Study title

Nylige isolering av thermoacidophilic metan-oksiderende bakterier som tilhører Verrucomicrobia avstamningen har utvidet vår forståelse av mangfoldet av biologisk metanoksidasjon. Disse mikroorganismene deler den unike muligheten til å bruke metan, en potent drivhusgass, som eneste karbon- og energikilde. Methylacidiphilum kamchatkensis, stamme Kam1, som laboratoriet har isolert fra en sur varm kilde i Kamchatka i Russland, vil bli brukt som en modell for videre molekylære og fysiologiske analyser av metanoksidasjon i disse organismene, som besitter 3-4 konservert "operone"r, der hver koder tre partikke med metan monooksygenase (PMO) protein subenheter. Foreløpige analyser indikerer at bare ett er funksjonelt, uttrykt i Kam1 under standard vekstbetingelser. Gjennom ytterligere transkripsjoner og proteomikk-analyse, vil effekten av miljøfaktorer som grunnbegrensning og tilgjengelig kobber, vil uttrykk for PMO "operoner" vurderes, samt mekanismer for regulerong av "operoner". De intracellulære polyhedralorganene i disse organismene er av særlig interesse; de kan representere en ny subcellulære mikrokammer for metanoksidasjon, for å kompensere for mangelen av det typiske PMO-assosierte intracellulære membransystem som finnes i andre methanotrophs. Disse unike intracellulære strukturene kan også spille en rolle i avgiftning og/eller karbonassimilering. Organellene vil bli isolert fra Kam1 og deres funksjonelle rolle vil bli vurdert. Mangfoldet og aktiviteten til metanotrofiske Verrucomicrobia -populasjoner fra andre geotermiske områder vil også bli undersøkt, delvis gjennom internasjonalt samarbeid. Resultatene fra dette prosjektet vil gi ny innsikt i utviklingen, og mangfoldet av biologiske metanoksidasjon, en antatt "gammel" metabolsk egenskap og viktig prosess for å dempe naturlige drivhusgasser. Datasettet består av DNA-sekvensdata i GBFF-format.